Empezó a funcionar en una casa grande, llamada colegio don Alfonso, ésta era arrendada por el municipio; más tarde fue trasladada a la edificación donde hasta hoy funciona ubicada en la Calle 12 Nº 6 – 63, barrio La Florida. En esta edificación funcionaba el colegio Bachillerato San Pablo de Polonuevo hasta el año 197. Es aquí donde inicia sus labores académicas con el nombre de Escuela Urbana para niñas, en ese entonces llega como directora la profesora María González De Osorio. Por iniciativa de la primera directora del Maria Emma y apoyada por la concejala del municipio de la época la señora Melci Arcón de Amador decide cambiar el nombre de escuela urbana para niñas a Concentración Educativa Nº 5 para niñas María Emma este gesto fue como un reconocimiento a una insigne educadora que murió en plena actividad docente en este centro educativo.  Aprobada la propuesta deciden hablar con sus hijos y estos en agradecimiento le obsequian una fotografía ampliada con su nombre que aún permanece en la sede. Después de la primera directora le siguieron en su orden:  Nuria Solano Vargas (Q E. P. D.), Noris Varela y Yésica Torres. 

Estando la seño Yesica, la sede cierra sus puertas hasta el año 2003 cuando se fusiona con la Institución Educativa San Pablo de Polonuevo mediante el decreto   Nº 000911 del 28 de noviembre del 2002. La profesora Casilda en calidad de rectora decide reabrir nuevamente nombrando como coordinadora a la profesora Ubaldina Martes de Mendoza funcionando el grado 5º tomando la modalidad por áreas. 

Actualmente la sede Nº 5 Maria Emma está bajo la coordinación de la licenciada Maria Paulina Martínez Tejeda  y los 14 profesores que la acompañan repartidos así:  jornada matinal laboran grado 5º profesoras: Cointa Rodríguez Martínez, Ibis Pozuelo Ramo, Carmen Márquez Martes, Deyarit Mancilla Casalins, Modesta Bustillo Barreto.

Aceleración profesora: Milagros Salas.

Brújula:  profesora Flora Cervantes.   

Jornada vespertina laboran grado 2º profesores: Adriana Peña Iglesias, Dalbert Martes Vargas, Nobel Cervantes Polo, Ana Cecilia Carmona, Claudia Ponce Polo, Yudis Sánchez Polo.